先天性肾功能不全一般是由遗传因素、母体妊娠期感染等原因引起的，可采用肾脏移植、透析和药物治疗等方式进行治疗，详情如下：
1. 肾脏移植：当患者的肾功能严重受损，无法维持正常生活时，肾脏移植是最有效的治疗方法之一。适用于肾功能衰竭且无法通过其他治疗手段改善的患者。移植的肾脏可以来自亲属或无关者，手术后患者需要服用抗排斥药物终身，以防止移植肾被患者免疫系统攻击。
2. 透析：透析是通过机器或人工膜替代肾脏的功能，去除体内的废物和多余液体。适用于早期肾功能不全患者，或无法进行肾脏移植的患者。透析方式主要有血液透析和腹膜透析两种，选择适合的方式取决于患者具体情况和医生建议。
3. 药物治疗：药物治疗可以通过改善肾小球滤过功能、减少蛋白尿等方式来保护肾脏功能。适用于肾功能不全早期或无法进行手术治疗的患者。常用的药物包括血管紧张素转化酶抑制剂、血管紧张素受体拮抗剂等，具体的治疗方案需要根据患者情况进行调整。
除以上相对常见的治疗方式外，还有其他的治疗方式，比如免疫治疗，适用于自身免疫性肾炎引起的先天性肾功能不全。免疫治疗可以通过调节免疫系统功能来减轻炎症反应，保护肾脏功能。具体的治疗方案需要根据患者病情和医生建议确定。